สาเหตุที่ทำให้ ลูกท้องเสีย อาจเกิดจากระบบการย่อยของลำไส้ อาจมาจากการกินอาหารที่มีไขมันสูงซึ่งจะส่งผลเสียโดยตรงต่อสุขภาพของลำไส้

ในบางครั้งเวลาที่ทารกถ่ายเหลว อุจจาระอาจมีเมือกออกมาด้วย ซึ่งสามารถก่อให้เกิดอันตรายต่อระบบทางเดินอาหารของเด็ก